پالایشگاه نفت سپاهان در سال ۱۳۷۱ به عنوان یکی از واحدهای پالایشگاه اصفهان آغاز به فعالیت نمود. این واحد پالایشگاهی در ابتدای مهر ماه سال ۱۳۷۸ به صورت یک شرکت سهامی خاص در اداره ثبت شرکتها و مالکیت صنعتی تهران به ثبت رسید. این شرکت طبق بند ج تبصره ۱۰ قانون بودجه سال ۱۳۷۹ به عنوان کارخانه روغن سازی پالایشگاه اصفهان به صندوق بازنشستگی، پس انداز و رفاه کارکنان صنعت نفت واگذار گردید. با واگذاری این شرکت از ابتدای سال ۱۳۸۱ و به استناد مصوبه مجمع عمومی فوق العاده صاحبان سهام مورخ ۱۳۸۱/۲/۲۸ نام شرکت از تصفیه روغن اصفهان به شرکت نفت سپاهان تغییر یافت.
شركت نفت سپاهان به عنوان يكی از بزرگترين توليد كنندگان روغن پایه و فرآورده های حوزه روانكار كشور، در راستای جلب رضايت مشتری همراه با حفظ حقوق ساير ذينفعان مصمم است همواره در چارچوب سيستم های مديريت یکپارچه بر اساس استانداردهای داخلی و بین المللی همچون ISO90012015 – ISO14001:2015 – ISO45001:2018 -ISO/TS29001:2020- IATF16949:2016 و الزامات خاص مشتریان، در جهت ارتقاء کیفیت در تولید محصولات، افزایش رضایت مندی ذینفعان، توسعه سرمایه های انسانی و سلامت کارکنان، حفاظت از محیط زیست، رعایت الزامات ایمنی و بهداشت، بهبود عملکرد انرژی، مسئولیت پذیری اجتماعی و بهبود فرآیند ها گام بردارد، این موارد بخش اصلی سیاست های اساسی و توسعه ای این سازمان می باشد.